Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt39Q6IFX4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms