Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms