Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nop58Q6DFW4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms