Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6DFW0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms