Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms