Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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