Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msl2Q69ZF8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms