Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms