Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2bQ64511 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms