Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms