Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2kQ63871 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms