Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcncQ62447 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms