Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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