Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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