Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ss18Q62280 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ss18Q62280 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ss18Q62280 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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