Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sprr1bQ62267 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms