Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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