Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RhocQ62159 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RhocQ62159 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms