Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc2Q62029 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms