Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms