Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcd1Q61466 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms