Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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