Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna2Q61301 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms