Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf4bQ61136 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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