Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms