Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk2a1Q60737 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk2a1Q60737 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms