Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms