Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms