Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmo1Q5SXG7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmo1Q5SXG7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms