Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms