Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms