Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms