Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms