Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms