Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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