Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pydc3Q3V3Q4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms