Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc185Q3V118 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc185Q3V118 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms