Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms