Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms