Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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D13Ertd608eQ3UPR8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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