Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms