Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf180Q3U827 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms