Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q3U6N9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q3U6N9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Q3U6N9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U6N9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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