Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hhla1Q3TYV2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms