Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrc28Q3TX51 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrc28Q3TX51 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms