Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TQQ9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms