Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms