Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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