Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sppl2bQ3TD49 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sppl2bQ3TD49 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sppl2bQ3TD49 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms