Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdss2Q33DR3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdss2Q33DR3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms